Nome del laboratorio ed ente di afferenza:
Centro di Ricerche Interdipartimentale di Scienze Computazionali e Biotecnologiche, Seconda Universitą di Napoli
Responsabile/referente: Prof. Giovanni Colonna
Descrizione sintetica delle attivitą svolte:
Ricerca: Relazioni struttura-funzione delle proteine; protein folding. Sviluppo software per gestione di dati clinici.
Didattica: Corso di Dottorato in Biologia Computazionale; corsi di Bioinformatica e Informatica.
Servizi: organizzazione dati, gestione di database per attivitą medico-sanitarie.
Risorse hw/sw disponibili:
HW: Server e sistemi di data-storage, postazioni PC.
SW: software specialistico e sviluppato internamente al gruppo per le attivitą sopra descritte
Pubblicazioni nel campo bioinformatico - biocomputazionale (max. 5):
1. Costantini S, Colonna G, Facchiano AM. FASMA: A Service to Format and Analyze Sequences in Multiple Alignments. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2007 5(3-4):253-255.
2. Costantini S, Facchiano AM, Colonna G. Evaluation of the structural quality of modeled proteins by using globularity criteria. BMC Struct Biol. 2007 Mar 9;7:9.
3. Chambery A, Pisante M, Di Maro A, Di Zazzo E, Ruvo M, Costantini S, Colonna G, Parente A. Invariant Ser211 is involved in the catalysis of PD-L4, type I RIP from Phytolacca dioica leaves. Proteins. 2007 Apr 1;67(1):209-18.
4. Costantini S, Colonna G, Facchiano AM. Simulation of conformational changes occurring when a protein interacts with its receptor. Comput Biol Chem. 2007 Jun;31(3):196-206.
5. Dosi R, Di Maro A, Chambery A, Colonna G, Costantini S, Geraci G, Parente A. Characterization and kinetics studies of water buffalo (Bubalus bubalis) myoglobin. Comp Biochem Physiol B Biochem Mol Biol. 2006 Oct;145(2):230-8.