Nome del laboratorio ed ente di afferenza:
NeuRoNe Lab, Dipartimento di Matematica e Informatica, Università di Salerno.
Responsabile/referente: Prof. Giancarlo Raiconi / Prof. Roberto Tagliaferri
Sito web del laboratorio o del referente
Parole chiave: clustering di dati -omics, visualizzazione interattiva di dati multidimensionali, feature selection
Descrizione sintetica delle attività svolte:
L’attività di ricerca è orientata alla produzione di un completo (dal preprocessing alla validazione) strumento per l'analisi non supervisonata di grandi data set
con elevate possibilità di interazione visuale, comprensiva di analisi, progettazione e messa punto di tecniche di clustering, l’applicazione dell'ottimizzazione
globale e di metodi di consenso per la meta analisi dei risultati.
Risorse hw/sw disponibili:
Varie workstation, centro di calcolo dipartimentale, software per l’analisi interattiva dei dati
Pubblicazioni nel campo bioinformatico - biocomputazionale (max. 5):
1. A. CIARAMELLA, S. COCOZZA, F. IORIO, G. MIELE, F. NAPOLITANO, M. PINELLI, G. RAICONI, TAGLIAFERRI R. (2008). Interactive data analysis and clustering of genomic data. NEURAL NETWORKS. vol. 21 ISSN: 0893-6080. doi:10.1016/j.neunet.2007.12.026
2. F. NAPOLITANO, G. RAICONI, TAGLIAFERRI R., A. CIARAMELLA, A. STAIANO AND G. MIELE. (2008). Clustering and visualization approaches for human cell cycle gene expression data analysis. INTERNATIONAL JOURNAL OF APPROXIMATE REASONING. vol. 47, pp. 70-84 ISSN: 0888-613X. doi:10.1016/j.ijar.2007.03.013
3. F. BISHEHSARI, M. MAHDAVINIA, R. MALEKZADEH, R. MARIANI-COSTANTINI, G. MIELE, F. NAPOLITANO, G. RAICONI, TAGLIAFERRI R., F. VERGINELLI. (2007). PCA Based Feature Selection Applied to the Analysis of the International Variation in Diet. LECTURE NOTES IN ARTIFICIAL INTELLIGENCE. vol. 4578, pp. 551-556 ISSN: 0302-9743.
4. R. AMATO, A. CIARAMELLA, N. DENISKINA, C. DEL MONDO, D. DI BERNARDO, C. DONALEK, G. LONGO, G. MANGANO, G. MIELE, G. RAICONI, A. STAIANO, TAGLIAFERRI R. (2006). A multi-step approach to time series analysis and gene expression clustering. BIOINFORMATICS. vol. 22, pp. 589-596 ISSN: 1367-4803.
5. R. AMATO, A. CIARAMELLA, C. DEL MONDO, L. DE VINCO, C. DONALEK, G. LONGO, G. MIELE, G. RAICONI, A. STAIANO, TAGLIAFERRI R. (2005). Novel techniques for microarray data analysis: Probabilistic Principal Surfaces and Competitive Evolution on Data. JOURNAL OF COMPUTATIONAL AND THEORETICAL NANOSCIENCE. vol. 2, pp. 514-523 ISSN: 1546-1955. Special issue on “Computational Intelligence for Nano-Science and Bioinformatics”.