>P1;1BW3Protein Sequence:
barwin (basic seed protein) (nmr, 20 structures) - barley
1 EQANDVRATY HYYRPAQNNW DLGAPAVSAY CATWDASKPL SWRSKYGWTASequence length: 12551 FCGPAGPRGQ AACGKCLRVT NPATGAQITA RIVDQCANGG LDLDWDTVFT
101 KIDTNGIGYQ QGHLNVNYQF VDCRD
F-HELIX results:
Sequence |---- N-capping motifs ---| |------- C-capping motifs ------|
Ia Ib IIa IIb IIIa IIIb IV Va Vb VIa VIb VIIa VIIb
1 E E 1 2 Q Q 2 3 A --1 A 3 4 N 2 N 4 5 D I 3 D 5 6 V b 4 --1 V 6 7 R 5 2 R 7 8 A --6 3 A 8 9 T II 4 T 9 10 Y a 5 Y 10 11 H 6 H 11 12 Y --7 Y 12 13 Y Y 13 14 R R 14 15 P P 15 16 A --1 --1 --1 A 16 17 Q 2 2 2 Q 17 18 N I 3 3 3 N 18 19 N a 4 II 4 V 4 N 19 20 W 5 b 5 a 5 W 20 21 D --6 6 6 D 21 22 L --7 --7 L 22 23 G G 23 24 A A 24 25 P P 25 26 A --1 A 26 27 V 2 V 27 28 S 3 S 28 29 A V 4 A 29 30 Y a 5 Y 30 31 C --1 6 C 31 32 A 2 --1 --7 A 32 33 T I 3 2 T 33 34 W b 4 3 W 34 35 D 5 II 4 D 35 36 A --1 --6 b 5 --1 A 36 37 S 2 6 2 S 37 38 K I 3 --7 3 K 38 39 P a 4 V 4 P 39 40 L 5 --1 a 5 L 40 41 S --6 2 6 S 41 42 W 3 --7 W 42 43 R II 4 R 43 44 S b 5 S 44 45 K 6 K 45 46 Y --7 Y 46 47 G G 47 48 W W 48 49 T T 49 50 A A 50 51 F --1 F 51 52 C 2 C 52 53 G I 3 G 53 54 P a 4 P 54 55 A 5 --1 --1 A 55 56 G --6 2 2 G 56 57 P 3 3 P 57 58 R II 4 VI 4 R 58 59 G b 5 a 5 G 59 60 Q 6 6 Q 60 61 A --7 7 A 61 62 A --1 --1 --8 A 62 63 C 2 --1 2 C 63 64 G I 3 2 3 G 64 65 K a 4 3 V 4 K 65 66 C 5 --1 V 4 b 5 C 66 67 L --6 2 a 5 6 L 67 68 R I 3 6 7 R 68 69 V --1 b 4 --7 --8 V 69 70 T 2 5 T 70 71 N I 3 --6 N 71 72 P a 4 P 72 73 A 5 --1 --1 --1 A 73 74 T --6 2 2 2 T 74 75 G I 3 3 3 G 75 76 A b 4 --1 III4 V 4 A 76 77 Q 5 2 b 5 b 5 Q 77 78 I --6 --1 3 6 6 I 78 79 T 2 II 4 7 7 T 79 80 A 3 b 5 --8 --8 A 80 81 R II 4 6 R 81 82 I --1 a 5 --7 I 82 83 V 2 6 V 83 84 D I 3 --7 D 84 85 Q a 4 Q 85 86 C 5 --1 --1 --1 C 86 87 A --6 2 --1 2 --1 2 A 87 88 N I 3 2 IV3 2 3 N 88 89 G b 4 3 4 3 V 4 G 89 90 G 5 II 4 5 V 4 b 5 G 90 91 L --6 b 5 --6 a 5 6 L 91 92 D 6 6 7 D 92 93 L --1 --7 --7 --8 L 93 94 D 2 D 94 95 W --1 3 --1 W 95 96 D 2 II 4 2 D 96 97 T I 3 a 5 3 T 97 98 V a 4 6 V 4 V 98 99 F 5 --1 --7 b 5 F 99 100 T --6 2 6 T 100 101 K I 3 7 K 101 102 I b 4 --1 --1 --8 I 102 103 D 5 2 2 D 103 104 T --6 3 IV3 T 104 105 N II 4 4 N 105 106 G a 5 5 G 106 107 I 6 --6 I 107 108 G --7 G 108 109 Y Y 109 110 Q Q 110 111 Q Q 111 112 G G 112 113 H --1 --1 H 113 114 L 2 --1 2 L 114 115 N I 3 2 3 N 115 116 V b 4 --1 3 V 4 V 116 117 N 5 2 II 4 b 5 N 117 118 Y --6 3 b 5 6 Y 118 119 Q II 4 6 7 Q 119 120 F a 5 --7 --8 F 120 121 V 6 V 121 122 D --7 D 122 123 C C 123 124 R R 124 125 D D 125
Ia Ib IIa IIb IIIa IIIb IV Va Vb VIa VIb VIIa VIIb
Sequence |---- N-capping motifs ---| |------- C-capping motifs ------|
Statistics
Motif No. of occurrence
Ia 7
Ib 7
IIa 5
IIb 8
IIIa 0
IIIb 1
IV 2
Va 5
Vb 5
VIa 1
VIb 0
VIIa 0
VIIb 0