HELM - Output Page


Protein Description:

>P1;1CRN
crambin - Abyssinian crambe
Protein Sequence:

   1   TTCCPSIVAR SNFNVCRLPG TPEAICATYT GCIIIPGATC PGDYAN 

Sequence length: 46

F-HELIX results:

Sequence  |---- N-capping motifs ---|  |------- C-capping motifs ------| 

          Ia   Ib  IIa  IIb IIIa IIIb  IV    Va   Vb  VIa  VIb VIIa VIIb

   1  T                                                                   T    1
   2  T                                                                   T    2
   3  C                                                                   C    3
   4  C  --1                                                              C    4
   5  P    2                                                              P    5
   6  S  I 3                                                              S    6
   7  I  a 4                                                              I    7
   8  V    5  --1                                --1                      V    8
   9  A  --6    2       --1                 --1    2                      A    9
  10  R       I 3         2                   2    3                      R   10
  11  S       b 4         3                   3  V 4                      S   11
  12  N         5      II 4                 V 4  b 5                      N   12
  13  F       --6       b 5                 a 5    6                      F   13
  14  N                   6                   6    7                      N   14
  15  V                 --7                 --7  --8                      V   15
  16  C                                                    --1            C   16
  17  R                                                      2            R   17
  18  L                                                      3  --1       L   18
  19  P                                                      4    2       P   19
  20  G                                                   VI 5    3       G   20
  21  T                                                    b 6 VII4       T   21
  22  P                                                      7  a 5       P   22
  23  E                                                      8    6       E   23
  24  A                                                    --9    7       A   24
  25  I                                                         --8       I   25
  26  C       --1                                                         C   26
  27  A         2  --1                                                    A   27
  28  T       I 3    2                                                    T   28
  29  Y       b 4    3                                                    Y   29
  30  T         5 II 4                                                    T   30
  31  G       --6  a 5                                                    G   31
  32  C              6                                               --1  C   32
  33  I            --7                                                 2  I   33
  34  I                                                                3  I   34
  35  I       --1                                                      4  I   35
  36  P         2                                                   VII5  P   36
  37  G       I 3                                                    b 6  G   37
  38  A       b 4                                     --1              7  A   38
  39  T         5                                       2              8  T   39
  40  C       --6                                       3            --9  C   40
  41  P                                              VI 4                 P   41
  42  G                                               a 5                 G   42
  43  D                                                 6                 D   43
  44  Y                                                 7                 Y   44
  45  A                                               --8                 A   45
  46  N                                                                   N   46
          Ia   Ib  IIa  IIb IIIa IIIb  IV    Va   Vb  VIa  VIb VIIa VIIb
Sequence  |---- N-capping motifs ---|  |------- C-capping motifs ------| 


Statistics

Motif  No. of occurrence

Ia        1 
Ib        3 
IIa       1 
IIb       1 
IIIa      0 
IIIb      0 
IV        0 
Va        1 
Vb        1 
VIa       1 
VIb       1 
VIIa      1 
VIIb      1